洁净室用途分类，根据用途可分为两类：
(1)工业洁净室——控制无生命的颗粒为对象。主要控制空气尘粒对工作对象的污染，内部一般保持正压。适用于精密机械行业、电子行业(半导体、集成电路等。)、航空航天工业、高纯化工、原子能工业、磁光产品工业(CD、胶片、磁带生产)、LCD(液晶玻璃)、计算机硬盘、计算机磁头生产等行业。
洁净室使用分类：
(2)生物洁净室，主要控制有生命的颗粒(细菌)和无生命的颗粒(灰尘)对工作对象的污染。可以分为；一、一般生物洁净室，主要控制微生物(细菌)物体的污染。同时，其内部材料应能承受各种灭菌剂的侵蚀，内部压力一般有保证。本质上，它的内部材质应该是一个可以承受各种灭菌处理的工业洁净室。例子：医药行业，医院(手术室、无菌病房)、动物实验室、理化实验室、血站等食品、化妆品、饮料产品的生产。
B.生物安全洁净室：主要控制工作物体的活粒子对外界和人的污染。和里面的大气保持负压。例如：细菌学、生物学、洁净实验室、材料工程(重组基因、疫苗制备)
