洁净室系统控制的核心是压差。如果压差控制不好，非洁净室的空气会被导入洁净室，对我们的净化系统，比如初、中、高效过滤器，客户的产品都会造成一定的损害。
为什么会这样？因为洁净车间的尘粒通过三级过滤进入车间，分布到各个角落，再通过回风口回收室内空气进行过滤。系统是一个循环的净化系统，任何一个环节出现问题都会对系统造成一定的影响，所以要保证没有一个。
以下是洁净室压差参数：
压力差
相邻洁净区房间的压差应为10-15帕斯卡(指导值)。- EUcGMP
洁净区和非洁净区之间以及不同等级的洁净区之间的压差应不小于10帕斯卡。相同洁净度等级、不同功能的手术室之间应保持适当的压差梯度，防止污染和交叉污染。-中国的新GMP
相邻洁净区之间的压差应为12.5帕斯卡-FDA。
气流自净
应该证明不存在各种空气流动方式造成污染的风险。例如，应采取适当的措施，确保气流不会将操作或设备和操作人员排放的颗粒吹到高洁净度要求的区域。所有操作结束后，操作人员应离开生产现场，进行15 ~ 20分钟的自清洁(指导值)，清洁区域应达到“静态”标准。
