洁净室净化工程设计是由相关专业综合完成的设计技术。它类似于一般的工厂设计，但也是独特的。其主要特点如下：
(1)根据洁净室净化工程拟生产产品的类别、品种或用途，确定设计洁净室净化工程的控制对象和技术要求。比如生物洁净室净化项目，控制对象是空气中的尘粒和微生物；不同产品或用途的生物洁净室净化工程对空气洁净度等级、空气中微生物的种类和浓度、压差等有不同的要求。再比如IC生产的洁净室净化工程，其控制对象主要是空气中的尘粒；根据集成电路的特征尺寸和集成度，对空气洁净度、抗微振动、高纯度物质等的要求。都不一样，要根据具体工厂的产品品种来确定。
(2)为保证洁净室净化工程中必要的空气洁净度，所有参与洁净室净化工程设计的专业设计应采取适当可靠的技术措施，减少或防止室内粉尘产生和微生物滋生，减少或防止将颗粒微生物或可能造成交叉污染的物质带入洁净室净化工程，并有效排出室内颗粒微生物，以减少或防止其在洁净室净化工程中滞留。当易碎生物或物料因尘粒而交叉污染会危及产品降雨或人身安全时，还应采取安全可靠的技术措施防止交叉污染，如严格控制不同洁净室净化工程之间的静压差、合理划分净化空调系统、按要求合理设计回风系统等。n
bsp;(3)、洁净室净化工程设计是各专业设计技术的综合，尤其是洁净室净化工程的工艺设计、空气净化设计和各种特殊要求的设计技术的密切协同、相互渗透和合理安排的综合设计。洁净室净化工程设计应做到顺应工艺(或使用)流程、合理选择各类设备和装置、尽力实现人流和物流的顺畅短捷、气流流型选样得当、净化空调系统配置合理、各种特殊要求的技术措施得当，洁净厂房的平面、空间布置合理，实现可靠经济运行的洁净厂房设施。
(4)、洁净室净化工程设计应确保安全生产和满足环境保护的要求。洁净室净化工程的稍置和各项设施的设计均必须符合消防、防火的要求，应按国家的有关标准、规范进行设计，由于洁净室净化工程内的平面和空间有差异性、走道曲折等特点，在进行各项技术设施的系统设计、设备配置和材质选样时，必须特别注意按规定选用符合要求的系统、设备和材料。
(5) 、随着科学技术的发展，工业产品的更新换代很快，人们对生活质量要求也越来越高，工业洁净室净化工程、生物洁净室净化工程的建造日新月异，因此洁净室净化工程设计本身便具有高新技术、技术密集和资金密集的特点，为了提高洁净室净化工程建成后的技术经济效益，在进行洁净室净化工程设计时应设法尽可能地考虑一定的灵活性，以便使建成后的洁净室净化工程能随着科学技术的发展更方便地进行技术改造，适应产品换代或设备更新的要求。近年来，在微电子工业超大规模集成电路生产、医药工厂用洁净厂房设计、建造中，模块式洁净室净化工程、隔离装置及微环境(MLnienvkMnment)的不断研究开发，并被广泛采用，便是一种能够适应技术发展的灵活的及有综合经济性的洁净厂房设计。
